بررسی حضور پروتئین hu در برخی از سویه های باکتری bacillus subtilis

بعضی از پروتئین های باکتریایی? به دلیل وجود برخی ویژگی های بیوشیمیایی مشابه با پروتئین های هیستونی یوکاریوتی? پروتئین های شبه هیستونی نامیده می شوند. پروتئین های خانواده hu? بزرگ ترین خانواده از پروتئین های شبه هیستونی هستند که در همه باکتری ها وجود دارند و توالی آمینواسیدی آنها? 20 درصد با هم شباهت دارند. توالی پروتئین hu می تواند حتی در سویه های یک گونه نیز متفاوت باشد. از بین گونه های مختلف باسیلوس مورد بررسی? پروتئین مشابه با hu جداسازی شده که hb نامگذاری گردیده است و مشخص شده که شباهت توالی آمینواسیدی این پروتئین در این گونه ها حدود 80 درصد می باشد. این پروتئین توسط ژن hbs کد می گردد. توالی ژن hbs تنها در یک سویه از باکتری b. subtilis (23857 atcc) بررسی شده است و در بانک ژنی وجود دارد. در این مطالعه? dna ژنومی متعلق به سه سویه از باکتری b. subtilis دارای atcc ?6633 12711 و 6051 ? استخراج شد و ژن hbs موجود در آنها توسط روش pcr بررسی گردید. محصولات pcr تعیین توالی شد و مشخص گردید که در سویه b. subtilis با6633 atcc ? تنها در یک نوکلئوتید نسبت به سویه مرجع (23857 atcc)? تفاوت وجود دارد اما در دو سویه دیگر (با6051 atcc و 12711) این توالی کاملا مشابه است. بنابراین در این مطالعه سویه دارای6633 atcc به عنوان مرجع? برای نخستین بار برای تهیه پروب غیر رادیواکتیو مورد استفاده قرار گرفت. محصول pcr در سویهb. subtilis با atcc 6633 به وسیله نوکلئوتید نشاندار شده با دیگ اکسی ژنین? نشاندار شد و شرایط تهیه پروب و دورگه سازی بهینه گردید و برای تعیین صحت آن از این پروب برای شناسایی ژن hbs در سویه b.subtilis atcc 6633 به وسیله روشblotting dot و southern blotting استفاده شد.